Afetlerin gerçekleşmesinin kaçınılmaz olduğu gerçeğinden hareketle, afet zararlarını azaltmayı, önlemlerini almayı ve etkilerini azaltmayı amaçlayan AFAD, misyonunu; “Afetlere dirençli toplum oluşturmak” Şeklinde belirlemiştir.
Depremler, seller, heyelanlar, kaya düşmeleri, kuraklıklar, fırtınalar ve diğer birçok afetin insan, çevre ve ekonomi üzerinde yıkıcı etkileri vardır. Ancak insan ve mekânların dirençliliğinin – insanlar ve mekânlar üzerindeki bu yıkıcı etkilere karşı koyma ve hızlı bir şekilde ayağa kalkma yeteneği artırılması mümkündür. Söz konusu dirençliliğin artırılması afetlerin zararlarını en aza indirecek ve afet sonrası toplumun ayağa kalkma süresini minimize edecektir. AFAD misyonunu bu bakış açısıyla belirlemiştir. Misyonumuz çerçevesinde AFAD’ ın sloganı; “Beklenmeyene hazırlıklıyız” olarak belirlenmiştir.

“Afet ve acil durumlar ile ilgili çalışmalarda sürdürülebilir kalkınmayı esas alan risk odaklı, etkin ve güvenilir   hizmet sunan uluslararası düzeyde model alınabilecek yönlendirici ve koordinatör bir kurum olmak.” şeklinde belirlenmiştir.
AFAD vizyonuyla; risk yönetimi odaklı, sürdürülebilir kalkınmanın önemine haiz, hizmet sunumunda etkinliğe ve güvenirliliğe özen gösteren yerel, ulusal ve  uluslararası düzeyde güçlü ve afet yönetiminde görev alan tüm kurum ve kuruluşları etkin bir şekilde koordine eden kurumsal bir yapı olmayı öngörmektedir.